транскрипционни фактори - позоваване химик 21

Химия и инженерна химия

Започване и регулиране на транскрипция в еукариотни ДНК с РНК полимераза в по-голяма степен, отколкото в прокариоти. Това зависи от много други протеини - транскрипционни фактори взаимодействат с дискретни части от ДНК, образуващи комплекс еукариотна pro.motor. Промоторният участък в близост до мястото на иницииране на транскрипция (PPC сайт) детектиран порции с характерните нуклеотидните последователности (мотиви), които имат цис-действие върху експресията на близкия ген. Тези елементи могат да взаимодействат с РНК полимераза и други протеини на транскрипция фактори. Различни протеинови ядрени транскрипционни фактори, които са регулаторни протеини. способен да се свързва към една или друга ДНК нуклеотидни последователности, като по този начин оказва влияние върху експресията на различни гени. Такива протеини. дифузна [c.195]

Развитието на многоклетъчни еукариотни организми се основава на способността на клетките да прехвърли между поколения активен или, обратно, потиска състояние на ген. Наследствено ген състояние в крайна сметка води до образуването на диференцирани тъкани, състояща се от клетки, в които само една малка част от гени активирани сред репресия основната част на генома. Изследването на молекулни механизми. осигуряване наследство активни или неактивни ген в редица клетъчни поколения, е от критично значение. Очевидно е, въз основа на тези механизми са не само програмируем взаимодействие на протеини и ДНК, предоставяща наследствено местна организация хроматин, но също така обработва на ДНК метилиране. Метилирането може .matrivat състезания като специален механизъм за контрол на транскрипцията, заедно със съществуващите механизми, въз основа на взаимодействието между цис-действащи регулаторни образуващи елементи и транскрипционни фактори. [C.218]

Въпреки отделен набор от регулаторни елементи от еукариотни структурни гени. всеки от тях има промоторната област (TATA кутия. Hognessa или прозорец) осем нуклеотида, съдържащи последователност TATA последователност ССААТ на (CAT кутия) част на повтарящ динуклеотид G (OS кутия). Тези елементи са разположени на разстояние от 25, 75 и 90 вр от мястото на иницииране, съответно (фиг. 3.23). Транскрипция на еукариотна структурен ген започва със свързване към софтуера на TATA кутия транскрипционен фактор (TFIID), който представлява комплекс от най-малко 14 протеини. След TF1ID и ДНК порции съседни странични су свързват други транскрипционни фактори TATA, [c.46]

Така областта на еукариотен промотор, се счита за специфичен ДНК гръбнака. която обединява транскрипционните протеини, които разпознават техните места на свързване и да си взаимодействат един с друг и с полимераза на РНК. Ние не можем да изключим, че факторите на транскрипция са ензими в хода на тези взаимодействия се извършват като ензимна модификация на протеинови фактори. и ДНК. Появата на нов транскрипционен фактор в диференцирани клетки може да се разглежда като начин за включване на гена за желания етап на развитие. [C.201]

Транс-действащи транскрипционни фактори, които се свързват с елементи pro.motora РНК полимераза I, не са проучени. Много повече се знае за структурата и механизмите на действие на протеинови транскрипционни фактори, които взаимодействат с РНК полимераза III. [C.209]

По този начин, регулацията на транскрипцията в еукариоти е много сложен процес. Структурният ген може да има множество регулаторни елементи. специфични сигнали, които се активират в клетки на различни видове по различно време на клетъчния цикъл. Въпреки това, някои от структурните гени под контрола на уникален транскрипционен фактор. Конкретни протеини могат да взаимодействат с някои регулаторни елементи и блокират транскрипцията или се свързват с всички транскрибционна инициаторна комплекс преди или по време на транскрипцията удължение. [C.47]

Фиг. 9-67. Някои стабилни комплекси. образувани транскрипционни фактори с еукариотни гени. Черен цвят показва определена ДНК последователност, която се смята за необходимо за функционирането на всеки ген промотори имат цвят подчертано области, които близо "присъединят фактори (въз основа на данни ДНК отпечатък, вж. Фиг. 4-69). Транскрипционни фактори са протеинова молекула ., която може да се състои от няколко подединици, въпреки че структурата на някои от тези фактори не е известна. тези цифри се отнасят до позицията на молекулата на ДНК (в нуклеотидните двойки) спрямо granskriptsii старт място,

Очевидно е, че РНК-полимеразата е в състояние правилно да се придържат към промотора само под формата на пълен golofermenta. Тя е съставена от субединици а, Р, (3 а и ф. При липса на лесно отделими фактор сигма (а) ензимът има пълен каталитична активност. Но не е способен да се свързва към специфична част на промотор ДНК. Това транскрипционен фактор (Sigma) играе вероятно важна роля в специфична свързваща ДНК полимераза. [c.481]

В еукариоти vscheleny и бе характеризиран както пет регулаторни протеини. наречен транскрипционни фактори (TF PA, PX, на IID на, а не IIF). Те са необходими за ДНК място за разпознаване (сайт), наречен TATA (на Ensus последователност TATAAAA). Подробно молекулярен механизъм на действие на транскрипционни фактори, все още не е разкрито. [C.539]

Два случая са известни, когато на разстояние израз на определени гени, както и включването на други поради подмяна SIG-ma-фактор. Един от тях явления, да образуват спори. или спорулация -consists в остри морфологични изменения, които носят бактериите в латентните форми (спори), способни да оцелеят неблагоприятни условия. Друг феномен се наблюдава по време на литични бактериофаги клетки инфекция. Когато инфекцията се развива по този начин, в крайна сметка, в резултат на размножаването на фаг клетка умира. Във всички случаи, най-лесният развитието на фаг, превключва транскрипция. Обаче, известно е само един добре проучени случай, промени, дължащи се на подмяна на транскрипционна специфичност на коефициента на клетка-сигма на фага. (Установено е, в бактерии, способни да образуват спори.) Повечето настъпят промени под действието на други механизми обичайно, с допълнителни транскрипционни фактори. Изглежда, че на регулаторния механизъм. въз основа на наличието на промени в най-РНК полимераза, с неохота се използва от клетката, и само като последна възможност. Вероятно е, че способността да се използват взаимозаменяеми помежду сигма фактори са еволюционно възникнали само в много ограничен брой бактерии. [C.157]

В транскрипционната активност на ДНК се оценява чрез взаимодействието му с РНК полимераза. Когато това се сравнява ДНК молекули, които са били предварително инкубирани с фактори на транскрипция, или молекули, които не са били подложени на такова лечение. Установено е, че РНК-полимеразата използва лесно за РНК синтеза ДНК молекули, свързани [c.146]

Молекулните механизми. чрез която описани промоторни елементи регулират транскрипцията, все още не е изяснен, но е известно, че активността на промоторни елементи, поради свързване към специфични протеинови фактори. осигуряващи точна и ефективна транскрипция на гена от РНК полимераза P. получени различни протеини, които взаимодействат с различни части на промотора, съдържащ TATA, ССААТ или G -motivg. Очевидно е, че има няколко протеини, способни да свържат ССААТ мотив. сред тях - хетеподимер. съставен от различни субединици. Протеин, научете G -motiv. Той се свързва с ДНК част съдържа 18-20 п. П. в центъра на който е елемент от G. Ефективността на промотора, поне частично, определено от ефективността на промотор отделен елемент (мотив) в състава, броят на тези елементи и тяхното взаимно режим. Тези елементи могат да работят в зависимост от средата на следващия нуклеотид. Резервни близките нуклеотиди могат значително да повлияят на ефективността на елемента. Така, например, замествания на нуклеотиди в удебелен шрифт заобиколени -motiva G (GGGG GGGG) може да намали активността на промотора. а заместването на първия G на Т е доста приемливо. Ако региона съдържа както промотора и G. СААТ елементи, различни транскрипционни протеинови фактори, взаимодействащи с тях, могат да активират транскрипцията съгласувано. [C.199]

Това разпределени зони А и Б. вълнообразна линия маркирана секвенция, необходима за експресията на различни гени, кодиращи протеини, индуцирани при топлинен шок. Гените, които са приложени към тази част на промотора, започват активно изразени при топлинен шок. промоторни региони А и Б от Drosophila топлинна шок ген са подчертани chetyrehnukleotidnye повтарящи се мотиви T G и GTT. Наличие на зона В е необходимо за пълна експресия на гена. Елементи А и В взаимодейства с протеин транскрипционни фактори имат сходни функционални свойства и имат синергичен ефект. активиране на транскрипция. Drosophila топлинен шок гени се въвеждат в клетки на бозайници. започне активно изразено при по-високи температури. Това подсказва, че не само на топлинния шок гени. но регулаторните елементи на системите за генни са доста консервативни в еволюцията. [C.200]

Принципи на действие на подобрители. в състояние да оказва своето влияние върху значително разстояние (повече от хиляда базови двойки), и независимо от ориентацията по отношение на началото на транскрипция не се разбира. Кратки нуклеотидни блокове могат да служат като места за свързване на определени ядрени протеини. в качеството на транс-действащи фактори. Силата на енхансер. Вероятно може да зависи от броя на тези блокове (модули). Ще разгледаме тези два основни механизма на действие на подобрители. Смята се, че функционалните части на генома, съдържащи един или повече гени. образуват дълги вериги, съдържащ хиляди нуклеотидни двойки от ДНК. Той изрази мнение, че примките се фиксират в матрицата на ядрото на клетката и може да бъде sverhspira-calized. Съставът включва матрица и топоизомераза е очевидно зад, единична ДНК верига топология (вж. Chap. KP), в такъв случай, с be.1kami за усилване на взаимодействие може да промени конформацията на целия цикъл, включително отдалечени от сегмента на усилване на ДНК, което води до в който състав варира вериги местната структура на хроматина и генна транскрипция се улеснява (фиг. 112.6). Тя е по-вероятно, че ефектът от подобрител. свързан с протеин определя от директен vzai.chodeystviem РНК полимераза и други транскрипционни фактори в процеса initsiatsii- Такова взаимодействие може да се дължи на огъване на ДНК молекула, която създава възможност за директно контактни зони промотор и енхансер отдалечен от него. свързани със специфични протеини (фиг. I2, в). [C.204]

Транскрипция на гени 5S РНК и тРНК се извършва с изолирани и пречистени протеини транскрипционен фактор е особено добре проучен транскрипционен фактор специфични TF Р1 А (Engl. Trans ription еа ТСР) 55 гени. Факторът е полипептид с L1, TOV = 40, той комуникира с вътрешен контролен елемент 55 ген. Той е последван от два други протеини се свързват и се присъединява към РНК полимераза. Една от характеристиките на ТФ протеин Р1 А се състои в това, че то специфично се свързва не само ДНК, но и с 5S РНК. Поради това, при високи концентрации [c.210]

Фиг. 3.24. Започване на транскрипция на структурния ген на еукариоти. Tigo първата транскрипция фактор се свързва с кутията TATA. след това се случи присъединяване други транскрипционни фактори и РНК полимераза II и накрая, спомагателни фактори предизвикват транскрипция. Arrow - посоката на транскрипция.

Блок генна експресия не може да се постигне само с помощта на терапия антисенс, но също така и за въвеждане в клетката олигонуклеотид, който се свързва към транскрипционен фактор или предаването, но този подход не е достатъчно проучен. Освен това, тъй като нуклеиновите киселини са способни да се свързват с протеини могат да бъдат синтезирани като олигонуклеотид (наречена аптамер), който ще бъде приложен към конкретен протеин. обикновено не са свързани с някоя от нуклеинови киселини. и блокират неговата функция. Така че, антитромбин аптамерл може да бъде средство евтини за предотвратяване на образуването на тромби в различни хирургически vmeschatelstvah. [C.508]

транскрипционен фактор (Транс ription еа ТСР) протеин, който помага РНК полимераза да премине всички етапи на транскрипция и осигуряване на селективността на процеса. [C.562]

Освен това, образуването на комплекс еукариотна започване изисква специални инициаторни протеини, наречени транскрипционни фактори като цяло. Нека разгледаме някои от тях по отношение на синтеза на иРНК. Те включват свързващ протеин TATA или TSB и 8-10 протеини, свързани с TBS. Те се наричат ​​TSB свързани фактори, бани или TAF. TSB и PAF TFPD образува комплекс, или транскрипционен фактор Drdya РНК полимераза II. [C.459]

Има известно основание да се смята, че е необходимо да активирате ген нарушение на структурата на хроматина. Транскрипция фактор ген 5S-РНК не активира гени ин витро, ако те са в комплекс с хистони. Въпреки това, този фактор може да се образува необходимата комплекс с безплатен ДНК, последвано от добавяне на хисто [c.392]

Както е отбелязано излугване, еукариотни РНК полимерази не разпознават техните промотори на пречистени ДНК молекули. За да стане това, ДНК трябва да се свържат един или повече сайт-специфични протеини. Такива протеини, наречени транскрипционни фактори (TF). Те се отличават от прокариоти сигма фактори (а-фактори), които могат да се свързват към ДНК независимо от РНК полимераза. Полимераза I, II и III изисква присъствието на различни транскрипционни фактори идентифицирани TF1, TFD и TFIII съответно. Латинска буква, която обикновено е последвано от римски цифри в заглавието на транскрипционния фактор показва как сметката беше подчертано този фактор. Например, TFIIIA - характеризира първата транскрипция фактор, който влияе на генната транскрибира полимераза III (5S-pPHK ген). [C.146]

Очевидно, ин витро транскрипционни фактори образуват доста стабилни транскрипционни комплекси. които селективно привличане молекули на РНК полимераза на своите промотори. Различни фактори са свързани с ДНК на различни места по отношение на разпоредбите на транскрипционното стартово място. 1 полимераза и полимераза II комплекс с транскрипционния фактор, който се свързва директно към сайта за начало на транскрипцията. Int> основният фактор на транскрипция на гена за четене полимераза III, ДНК се присъединява непосредствено зад транскрипционното стартово място, и по този начин, РНК полимераза III трябва да изпълнява своята функция без преместване на протеин от ДНК (фиг. 9-67). Смята се, че този фактор (TFIII) ДНК ветрове върху себе си, образувайки голяма нуклеопротеин -vuyu частиците. [C.146]