Нуклеозиди и нуклеотиди

Свободната база е значително по-широко разпространен в природата от съответните нуклеозиди и нуклеотиди. (Фиг. 34.8) молекули нуклеозиди са конструирани на пуринова или пиримидинова база, към който (-връзките свързан въглехидрат (обикновено -riboza или -dezoksiriboza) в N, или съответно позиция Така аденин Рибонуклеозидно (аденоза), и включва аденин. - рибоза, прикрепена в позиция guanoziniz -ribozy гуанин и цитозин на позиция tsitidiniz и рибоза в позиция uridiniz урацил и рибоза в позиция N, и връзка -dezoksiribozy рибоза или основа на структурата на пръстеновиден се дължи на относително кисела GR Labi Noy -glikozidnoy връзка. Теоретично остатък захар и пурин (или пиримидин), основата може да се върти свободно около оста на гликозидна връзка, но в действителност има пространствена пречка за това. конформация анти значително по-предпочитано от за естествени нуклеозиди (фиг. 34.9). подробно обяснение за това явление ще намерите в Sec. 37. Тук ще кажа само, че под формата на антидъмпинговите мерки, е предпоставка за допълване на пуринови и пиримидинови бази в молекула dezoksiribonu двойноверижна В форма kleinovoy киселина. (Тъй като D-рибоза е изобразен в конвенционална форма в повечето от фигурите и другите глави, пуринови и пиримидинови нуклеозиди и нуклеотиди са показани в -conformation по-малко предпочитано).

Структурата на 2-деоксирибонуклеозиди са пуринова или пиримидинова база и -dezoksiriboza прикрепени към същия атом

Фиг. 34.7. Структурата на тавтомерите на цитозин, тимин. аденин и гуанин, което показва, преобладаващите форми.

Фиг. 34.8. Структурата на РНК нуклеозиди.

Фиг. 34.9. Структурата на син и antikonfiguratsy аденозин.

Фиг. 34.10. Структура adenylic киселина (AMP) (вляво) и 2-dezoksiadenilovoy киселина (влажен) (вдясно).

Фиг. 34.11. Структура на uridylic киселина (UMP) (вляво) и тимидилова киселина (ТМР) (вдясно).

Нуклеотидите - нуклеозиден производни фосфорилирани от една или повече хидроксилни групи на рибозата (или деоксирибозата) (фиг. 34,10). Така, аденозин монофосфат (AMP или аденилат), изграден от аденин, рибоза и фосфат. 2-Dezoksiadenozinmonofosfat (влажна или dezoksiadenilat) е молекула, състояща се от аденин, 2-деоксирибоза и фосфат. Обикновено урацил е прикрепена към рибозата да тимин-2-деоксирибоза. Следователно, тимидилова киселина (TSR) се състои от тимин, 2'-деоксирибоза и фосфат. и част от uridylic киселина (UMP) включва урацил и рибоза фосфат (фиг. 34,11). ДНК е полимер на тимидилова, dezoksitsitidilovoy-2, 2-dezoksiadenilovoy и 2-deoxyguanylic киселина. РНК се получава чрез кополимеризация uridylic, cytidylic, Guanylic киселина и adenylic.

В допълнение към тези форми на нуклеотиди и нуклеотиди намерено необичайно структура. Така в тРНК молекула идентифицирани нуклеотид, където рибозата е прикрепена към урацил в пета позиция, т.е.. E. Не азот-въглеродна връзка и въглерод-въглерод. тази необичайна допълнение продукт, наречен pseudouridine (у). ТРНК молекули съдържат нуклеотидна и друг необичайно структура - тимин свързан към ribozomonofosfatom. Този нуклеотид се формира след синтез тРНК молекула чрез метилиране остатък UMP S-аденозилметионин (см. По-долу). Psevdouridilovaya киселина също се образува в резултат на прегрупирането след UMP синтез тРНК.

Номенклатура на нуклеозиди и нуклеотиди

Позицията на фосфатни групи в нуклеотидна молекула е показана цифра. Например, аденозин е фосфатна група прикрепена към въглеродния атом на рибоза следва да бъде определен като монофосфат. Баркод следните фигури дават да се разграничат броя на въглерод в пуринова или пиримидинова база от позицията на атом в остатък (деокси) рибозата. Когато номерирането на въглеродните атоми на основната лента не се поставя. Нуклеотидната -dezoksiadenozin фосфатен остатък при въглерод-5 молекула на захар е посочена като 2-деоксиаденозин-5-монофосфат (фиг. 34,12).

Nucleosides съдържащи аденин, гуанин, цитозин, тимин и урацил, обикновено обозначени с буквите А, G, С, Т и U, съответно. Като предварително нарязани писмо г показва, че въглехидратната компонент на нуклеозид е 2-деоксирибоза. Гуанозин включващ -dezoksiribozu може да бъде определен гд (деоксигуанозин) и съответния монофосфат, фосфатна група, прикрепена към третия въглероден атом на деоксирибоза, -dG-3-МР. Типично, в тези случаи, когато фосфата е прикрепен към 5-въглерод на рибозата или деоксирибозата, символ 5 се пропуска. По този начин, гуанозин 5-монофосфат обикновено обозначен с GMP, 5-монофосфат 2'-деоксигуанозин съкращение DGMP. Ако въглехидратен остатък прикрепен нуклеозид 2 или 3 остатъка на фосфорна киселина.

Фиг. 34.12. Структура 3 аденозин монофосфат (вляво) и 2-доксиаденозин-5-монофосфат (вдясно).

Фиг. 34.13. Структурата на АТР и съответните ди- и монофосфат форми.

Използвани съкращения DP (дифосфат) и TP (трифосфат). Така, аденозин трифосфат + с три фосфатни групи в 5-та позиция на въглехидрати ще бъде означен АТР. АТР структура, както и съответния ди- и монофосфати е показано на фиг. 34.13. Тъй като молекулите са нуклеотидни фосфати като анхидриди на фосфорната киселина, т. Е. В състояние с ниска ентропия, те се наричат macroergs (с голям резерв от потенциална енергия). Хидролиза на 1 мол АТФ до АДФ е освободен за потенциалната енергия.